別藻藍蛋白 APC是由藻膽蛋白提取出的一種熒光染料。藻膽蛋白由許多亞基組成，每個亞基具有蛋白質骨架，線性四吡咯發色團與其共價結合。藻紅蛋白（紅色）和藻藍蛋白（藍色）是兩種主要的藻膽蛋白。藻紅蛋白（PE）的吸收大值介于490和570nm之間，而藻藍蛋白（PC）的吸收大值介于610和665nm之間。通常，當作為硫酸銨沉淀物冷藏儲存時，藻膽蛋白具有良好的長期穩定性。純化的膽脂蛋白可以在酸性或堿性條件下解離成亞基，但在室溫下在中性pH下相對穩定，濃度大于0.1mg / mL。解離的亞基通常具有比天然色素更低的著色和熒光。建議將所有藻膽蛋白及其結合物（優選在中性緩沖溶液中）冷藏，從不冷凍。

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